Python Module Index

m | r | s
 
m
magmap
    magmap.atlas
    magmap.atlas.atlas_refiner
    magmap.atlas.edge_seg
    magmap.atlas.labels_meta
    magmap.atlas.ontology
    magmap.atlas.reg_tasks
    magmap.atlas.register
    magmap.atlas.transformer
    magmap.brain_globe
    magmap.brain_globe.bg_controller
    magmap.brain_globe.bg_model
    magmap.cloud
    magmap.cloud.notify
    magmap.cv
    magmap.cv.chunking
    magmap.cv.classifier
    magmap.cv.colocalizer
    magmap.cv.cv_nd
    magmap.cv.detector
    magmap.cv.segmenter
    magmap.cv.stack_detect
    magmap.cv.verifier
    magmap.gui
    magmap.gui.atlas_editor
    magmap.gui.atlas_threads
    magmap.gui.event_handlers
    magmap.gui.image_viewer
    magmap.gui.pixel_display
    magmap.gui.plot_editor
    magmap.gui.roi_editor
    magmap.gui.verifier_editor
    magmap.gui.vis_3d
    magmap.gui.vis_handler
    magmap.io
    magmap.io.cli
    magmap.io.df_io
    magmap.io.export_regions
    magmap.io.export_rois
    magmap.io.export_stack
    magmap.io.importer
    magmap.io.libmag
    magmap.io.load_env
    magmap.io.naming
    magmap.io.np_io
    magmap.io.packaging
    magmap.io.sitk_io
    magmap.io.sqlite
    magmap.io.subproc_io
    magmap.io.yaml_io
    magmap.plot
    magmap.plot.colormaps
    magmap.plot.plot_2d
    magmap.plot.plot_3d
    magmap.plot.plot_support
    magmap.settings
    magmap.settings.atlas_prof
    magmap.settings.config
    magmap.settings.grid_search_prof
    magmap.settings.logs
    magmap.settings.prefs_prof
    magmap.settings.profiles
    magmap.settings.roi_prof
    magmap.stats
    magmap.stats.atlas_stats
    magmap.stats.clustering
    magmap.stats.mlearn
    magmap.stats.vols
    magmap.tests
    magmap.tests.test_chunking
    magmap.tests.test_classifier
    magmap.tests.test_cv_nd
    magmap.tests.test_detector
    magmap.tests.test_img_equality
    magmap.tests.test_libmag
    magmap.tests.test_np_io
    magmap.tests.unit_testing
 
r
run
 
s
stitch
    stitch.tile_config