Python Module Index

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	`magmap`
	`magmap.atlas`
	`magmap.atlas.atlas_refiner`
	`magmap.atlas.edge_seg`
	`magmap.atlas.labels_meta`
	`magmap.atlas.ontology`
	`magmap.atlas.reg_tasks`
	`magmap.atlas.register`
	`magmap.atlas.transformer`
	`magmap.brain_globe`
	`magmap.brain_globe.bg_controller`
	`magmap.brain_globe.bg_model`
	`magmap.cloud`
	`magmap.cloud.notify`
	`magmap.cv`
	`magmap.cv.chunking`
	`magmap.cv.classifier`
	`magmap.cv.colocalizer`
	`magmap.cv.cv_nd`
	`magmap.cv.detector`
	`magmap.cv.segmenter`
	`magmap.cv.stack_detect`
	`magmap.cv.verifier`
	`magmap.gui`
	`magmap.gui.atlas_editor`
	`magmap.gui.atlas_threads`
	`magmap.gui.event_handlers`
	`magmap.gui.image_viewer`
	`magmap.gui.pixel_display`
	`magmap.gui.plot_editor`
	`magmap.gui.roi_editor`
	`magmap.gui.verifier_editor`
	`magmap.gui.vis_3d`
	`magmap.gui.vis_handler`
	`magmap.io`
	`magmap.io.cli`
	`magmap.io.df_io`
	`magmap.io.export_regions`
	`magmap.io.export_rois`
	`magmap.io.export_stack`
	`magmap.io.importer`
	`magmap.io.libmag`
	`magmap.io.load_env`
	`magmap.io.naming`
	`magmap.io.np_io`
	`magmap.io.packaging`
	`magmap.io.sitk_io`
	`magmap.io.sqlite`
	`magmap.io.subproc_io`
	`magmap.io.yaml_io`
	`magmap.plot`
	`magmap.plot.colormaps`
	`magmap.plot.plot_2d`
	`magmap.plot.plot_3d`
	`magmap.plot.plot_support`
	`magmap.settings`
	`magmap.settings.atlas_prof`
	`magmap.settings.config`
	`magmap.settings.grid_search_prof`
	`magmap.settings.logs`
	`magmap.settings.prefs_prof`
	`magmap.settings.profiles`
	`magmap.settings.roi_prof`
	`magmap.stats`
	`magmap.stats.atlas_stats`
	`magmap.stats.clustering`
	`magmap.stats.mlearn`
	`magmap.stats.vols`
	`magmap.tests`
	`magmap.tests.test_chunking`
	`magmap.tests.test_classifier`
	`magmap.tests.test_cv_nd`
	`magmap.tests.test_detector`
	`magmap.tests.test_img_equality`
	`magmap.tests.test_libmag`
	`magmap.tests.test_np_io`
	`magmap.tests.unit_testing`

	r
	`run`

	s
	`stitch`
	`stitch.tile_config`